2011年是“十二五”规划的开局之年，也是全面推进医药卫生体制改革、进一步完善我州新农合制度建设关键的一年，全州新农合工作在州委州政府的领导下，稳定提高农民参合率水平，努力提高新农合基金使用效率和参合农民医疗费用补偿水平，加强信息化建设，全面推进新农合支付方式改革，实现了新农合制度健康持续发展。
根据国家对新农合的财政补助标准提高到200元，全州及时调整并统一了新农合补偿政策，基本实现了参合农民在全州各级医疗机构就医享受同等政策待遇，提高了参合农民受益水平；统一了州级新农合目录和补偿政策，借助省级新农合信息平台实现对州级定点医院的统一管理，有力促进了州级新农合定点医院的规范化服务；全州各县市及有关单位克服了各种困难，努力推进新农合信息化建设，为参合农村居民发放磁条卡235万张，全州实现农村居民健康“一卡通”；积极探索实施提高农村参合重病患者医疗保障水平，儿童先心病、白血病、重性精神病和宫颈癌、乳腺癌等重大疾病享受全省统一的新农合补偿政策，终末期肾病患者在州级定点医院将享受比全省其他地区更优惠的政策，极大地缓解了农村重病患者的就医负担；各地在总结和借鉴新农合支付方式改革试点经验的基础上，大力推进新农合支付方式改革，推行按人头付费、按床日付费、按病种付费和总额预付等多种支付方式，有效控制了医疗费用的不合理增长并保证了新农合基金的安全。
2011年全州实际参合农民3220947人，参合率达到96.87%，同比2010年上升了2.1个百分点；新农合当年筹资总额达到7.4亿元，其中政府补助6.44亿元，政府资助重度残疾等困难群众免费参合274566人计823.698万元；全年参合农民住院342715人次，实际发生医疗费用99051.7万元，实际补偿参合农民52937.2万元，统筹区域内新农合政策范围内住院费用报销比例达到70.73%，超过省下达的70%的指标；实际平均补偿率达到了53.44%，超过省下达50%的指标；所有统筹地区新农合的统筹基金最高支付限额提高到6万元以上。全年门诊统筹共计补偿824.5556万人次，实际发生费用29359.2万元，次均费用35.6元，实际补偿10647.7万元，次均补偿12.9元，平均补偿比例为36.27%；全年住院分娩定补23639人，补偿基金603.5446万元；门诊慢病补偿6857人，补偿基金278.9108万元；大病二次补助4992人，补偿基金1013.5683万元；全州对提高农村重大疾病新农合医疗保障水平试点六个病种（儿童先心病、儿童白血病、重性精神病、终末肾病、宫颈癌、乳腺癌）累计补助479人，补助资金250.9万元，平均补助率达到70%。
